UV柔印工藝的主要缺點在于其較高的綜合成本。UV柔印需要專用的UV固化設備以及價格較為昂貴的UV油墨，同時印版和設備的初期投入也相對較大，這使得整個工藝的運營成本顯著高于許多傳統(tǒng)印刷方式，對企業(yè)的資金實力提出了更高要求。
在印刷適性和操作層面，UV柔印工藝存在一定的局限性。UV油墨在印刷過程中粘度較高，流平性相對較差，對印刷壓力和工藝參數(shù)的控制要求極為精細，否則容易產生印刷品網(wǎng)點擴大或實地不平服等問題，增加了工藝調試和穩(wěn)定生產的難度。
此外，UV柔印對承印材料的范圍也存在限制。并非所有材料都適用于UV柔印，部分塑料薄膜或特殊材質表面與UV油墨的附著力可能不佳，容易出現(xiàn)油墨脫落或固化不徹底的情況，這在一定程度上限制了該技術在更廣泛包裝領域的應用。
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